<font id="jvfph"><ruby id="jvfph"></ruby></font>

    <sub id="jvfph"></sub>

          <output id="jvfph"><strike id="jvfph"><p id="jvfph"></p></strike></output>

              <menuitem id="jvfph"><ruby id="jvfph"></ruby></menuitem>

              <menuitem id="jvfph"></menuitem>

                科研

                首頁 - 全部文章 - 科研 - 16種癌癥類型、超30萬個細胞!新泛癌T細胞圖譜揭示腫瘤浸潤T細胞“罷工”新方式 | Nat Med

                16種癌癥類型、超30萬個細胞!新泛癌T細胞圖譜揭示腫瘤浸潤T細胞“罷工”新方式 | Nat Med

                腫瘤浸潤性T細胞(TIL)是腫瘤免疫微環境(TIME)的重要組成部分,并顯示出抗癌功效,例如嵌合抗原受體(CAR)T細胞療法、TIL療法和免疫檢查點阻斷(ICB)療法,為癌癥治療提供了一個有前景的途徑。TIL在表型和功能上極具多樣性,其在免疫微環境中的表型特征和細胞組成成分決定了抗癌療法的有效性和潛在的副作用。鑒于TIL具有顯著的異質性,并且目前以T細胞為主的療法或聯合治療已迅速擴展到不同癌癥類型中,因此對TIL進行全面、深入的分析是必要的。

                近日,美國MD安德森癌癥中心的研究團隊在Nature Medicine上發表了題為“Pan-cancer T cell atlas links a cellular stress response state to immunotherapy resistance”的文章。該研究構建了基于16種癌癥類型308,048個腫瘤浸潤T細胞轉錄組數據的T細胞單細胞圖譜,揭示了以前未描述的T細胞狀態、濾泡輔助T細胞、調節性和增殖性T細胞的異質亞群,并發現了一種獨特的應激反應狀態——TSTR,以熱休克基因表達為特征。此外,研究團隊還創建了注釋良好的T細胞參考圖譜、交互式門戶網站和自動校準/注釋工具,為T細胞治療優化和生物標志物的發現提供了寶貴資源。

                文章發表在Nature Medicine

                研究團隊分析了來自27個單細胞RNA測序數據集的T細胞,包括9個獨特的MD安德森數據集,共涵蓋16種癌癥類型。研究團隊繪制了新的泛癌T細胞圖譜,這是迄今為止對TIME中存在的T細胞異質性表征最詳細的圖譜。新的泛癌T細胞圖譜共識別出32種不同的T細胞亞群,揭示了T細胞表型狀態以及每種狀態的相對比例如何在決定免疫治療有效性和潛在不良反應方面發揮關鍵作用。

                “這種大型數據集和全面的泛癌癥分析為我們提供了一個機會,可以觀察到在研究單一癌癥類型甚至少數癌癥類型時無法發現的信息,”文章通訊作者Linghua Wang博士說道,“我們希望這些高分辨率圖譜,包括徹底表征的T細胞狀態,能夠促進未來T細胞研究和生物標志物發現?!?/p>

                圖1. T細胞的泛癌分析:數據收集和主要T細胞類型。

                值得注意的是,該研究發現了一個先前未被描述的T細胞應激反應狀態“TSTR”(T cell stress response state),揭示了腫瘤浸潤T細胞的“罷工”新方式。在以往的單細胞研究中,這些T細胞經常被忽視或被認為是與組織分離過程相關的人工產物。但目前基于大量可用的數據,研究人員發現TSTR細胞是一個獨特的群體,與其他CD4或CD8 T細胞亞群存在明顯區別,并通過多種空間分析方法在多種不同癌癥類型的TIME中原位檢測到其存在(圖2)。結果顯示,TSTR細胞主要存在于淋巴細胞聚集物、腫瘤床或周圍腫瘤邊緣潛在的三級淋巴樣結構中。

                圖2. 使用多種不同的空間分析方法原位檢測TSTR細胞。

                TSTR細胞可以被認為是“壓力過大”的T細胞,就像一個壓力大的人工作效率較低一樣,其在對抗癌癥方面效果較差。在TIME中,TSTR細胞和耗竭性T細胞(exhausted T cells)都可能出現功能受損,但TSTR細胞似乎遵循了一條獨特的、與耗竭性T細胞軌跡不同的分化途徑(圖3)。

                圖3. T細胞分群及細胞分化。

                TSTR細胞的特征是高熱休克基因表達(圖3c)。研究團隊分析了來自23個隊列的375例患者,其中171例患者接受了免疫檢查點抑制劑治療,對T細胞狀態進行了研究。結果顯示,所有患者的T細胞狀態/組成與基因組、病理和臨床特征相關。值得注意的是,在進行免疫檢查點抑制劑治療后,CD4和CD8 T細胞中TSTR細胞的比例顯著提高、熱休克基因表達顯著上調,特別是在無應答患者中。上述結果表明,TSTR細胞可能在免疫治療抗性中發揮作用。綜上,這種新的T細胞狀態加深了人們對癌癥復雜生物學的理解,并為未來的治療提供了潛在的靶點。

                “TSTR細胞存在于許多不同類型的腫瘤中,這為我們開辟了一個充滿可能性的全新世界?!盠inghua Wang博士表示,“研究T細胞應激反應的機制原因、了解這些應激T細胞如何在TIME中被誘導以及學習如何停止或逆轉這種TSTR狀態,可以促進更有效的治療策略的發展,為更多的癌癥患者帶來免疫治療益處。

                該研究還強調了大型綜合數據集在腫瘤學中的價值,全面的泛癌T細胞圖譜展示了大數據分析的力量,并揭示了腫瘤內T細胞的復雜性。“但目前還有很多問題有待探究,”Linghua Wang博士說道,“這項研究的局限性之一是大多數分析數據集沒有相應的T細胞受體數據。我們不確定是什么觸發了TSTR狀態,也不知道其起源于哪個T細胞亞群。這些TSTR細胞是否對腫瘤細胞有特異性、其如何影響TIME中的其他細胞等目前仍不清楚?!?/p>

                研究團隊通過單細胞研究門戶網站(一個用戶友好的交互式門戶網站)分享了這一T細胞圖譜,該網站允許內部和外部用戶在不具備生物信息學技能的情況下可視化和查詢圖譜。此外,研究團隊還開發了一種名為TCellMap的工具,通過與該研究生成的高分辨率T細胞圖譜進行比對,研究人員可在其數據集中自動注釋T細胞。

                綜上所述,該研究提供了一個高分辨率的T細胞圖譜,其中包含明確的細胞狀態和基因特征。研究團隊共表征了32種T細胞狀態,并進一步確定了CD4調節亞群中的七個亞群、CD4濾泡輔助性T細胞群中的五個亞群以及增殖T細胞中的8個狀態。這些發現強調了腫瘤微環境中T細胞狀態的廣泛異質性,以及進一步了解這些狀態如何促進疾病進展和免疫治療反應的必要性。該研究結果可幫助科研人員對T細胞進行深入分析,促進開發能夠強化T細胞治療的策略。

                參考文獻:
                1.Chu, Y., Dai, E., Li, Y. et al. Pan-cancer T cell atlas links a cellular stress response state to immunotherapy resistance. Nat Med?(2023). https://doi.org/10.1038/s41591-023-02371-y

                2.https://medicalxpress.com/news/2023-05-pan-cancer-cell-atlas-reveals-tumor.html

                (0)

                本文由 SEQ.CN 作者:白云 發表,轉載請注明來源!

                熱評文章

                好涨太粗进去用力快好深视频_试衣间和老师疯狂试爱_巨大巨粗巨长 黑人长吊_妇女满足农民工特级毛片

                  <font id="jvfph"><ruby id="jvfph"></ruby></font>

                  <sub id="jvfph"></sub>

                        <output id="jvfph"><strike id="jvfph"><p id="jvfph"></p></strike></output>

                            <menuitem id="jvfph"><ruby id="jvfph"></ruby></menuitem>

                            <menuitem id="jvfph"></menuitem>