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                探基學院 × Oxford Nanopore丨系列講座之納米孔測序為臨床病原菌診斷帶來的機遇

                在研究環境下,對病原體樣品進行快速抗微生物藥物耐藥性表征使得研究者能更好地了解耐藥性及進化情況。在臨床環境中,進行快速診斷以鑒定抗微生物藥物耐藥性,能夠幫助選擇恰當治療方式,優化抗菌藥物管理,預防發生進一步耐藥性和疾病蔓延。相應的,微生物檢測技術也不斷改進。

                近年來,納米孔讀長已作為一項獨立工具或作為混合測序方法的一部分,成功應用于微生物(微生物組)、病原體鑒定、以及抗微生物藥物耐藥性分析。技術的提升使數分鐘內完成病原體從采樣到獲得結果的常規診斷過程逐漸成為可能,且已有效推進了傳染性生物體的檢測和抗微生物藥物耐藥性研究領域的發展。

                2019年新年伊始,探基與Oxford Nanopore Technologies聯合策劃,為大家帶來了目前國內科學家們在微生物的不同領域中,使用納米孔測序的系列講座。本套講座課程主要圍繞微生物鑒定、抗微生物藥物耐藥分析等領域,為有興趣在該領域發展的研究者、產業從業者提供學習資料和交流平臺。

                通過本系列講座,您可以獲得以下知識:

                1.?第二代和第三代測序技術的特點解析;

                2.?納米孔測序技術的原理和獨特優勢所在;

                3.納米孔測序技術在微生物鑒定和抗微生物藥物耐藥分析中的應用實例;

                4.納米孔測序技術在臨床微生物研究中的應用和展望。

                首發課程——《納米孔測序帶給臨床病原菌診斷的機遇》

                付愛思? ?武漢大學藥學院博士

                本系列首節課程講師為武漢大學藥學院付愛思博士。付愛思博士曾任武漢生物技術研究院技術平臺研發副主管。主要從事微生物、動植物、人類健康領域相關測序及相關技術的研究開發工作,長期負責新一代測序技術在各領域的應用與推廣。目前于武漢大學藥學院攻讀博士學位,致力于納米孔測序技術在臨床領域的技術開發與應用。參與的重大科研項目發表在Nature?Genetics、Nature?Communications等重磅期刊上,擁有豐富的第三代測序相關項目經驗。

                在本次課程中,付博士將介紹他們使用納米孔測序的經驗和取得的結果:

                1. 在一張MinION測序芯片完成多個細菌分離株基因組組裝;

                2.?長納米孔讀長應用于靶向測序分析,創建系統發生樹;

                3.?長納米孔讀長在16S rRNA測序中的優勢;

                4.?納米孔技術可實現直接RNA測序;

                5.?納米孔長讀長改進宏基因組組裝,分析人類腸道微生物移動原件;

                6.?便攜式納米孔測序在臨床研究中的應用實例。

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                注:Nanopore技術目前僅供研究使用。

                講座內容含未發表的研究數據,未經允許,請勿擅自使用。

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                本文由 SEQ.CN 作者:陳初夏 發表,轉載請注明來源!

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